Deutsches Krebsforschungszentrum (DKFZ)
Software Developer - Interoperability for Single-Cell and Spatial Omics Methods(m/w/x)
Vollzeit/Teilzeit
mit Homeoffice
Berufserfahren
Keine Angabe
Heidelberg
EU
European Molecular Biology Laboratory8 Tage
Research Software Engineer - Spatial-omics(m/w/x)
Vollzeit
mit Homeoffice
Berufserfahren
ab 4.031 / Monat
Heidelberg
Nejo KI-Zusammenfassung
In this role, you will enhance the SpatialData framework by developing robust software and maintaining its codebase. You will also contribute to key bioimaging data formats and ensure smooth software operations through automation and improved documentation.
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Anforderungen
- •Master’s degree in Computer Science, Mathematics, Physics, Engineering, Life Sciences, or related field, or proven equivalent experience
- •Knowledge of Python libraries: dask, xarray, geopandas, zarr, ome-zarr, napari, AnnData, Scanpy, SpatialData, or other scverse software
- •Curiosity-driven mindset toward new methods and tech
- •Passion for open-source software and commitment to reducing adoption barriers
- •Excellent communication and organisational skills
- •Proven ability to work creatively and rigorously in a team environment
- •Fluency in English
- •Experience contributing to open-source projects, using git and familiar with GitHub workflows
- •Background in user support (software support, scientific support)
- •Bioinformatics experience in single-cell and spatial biology with a learning mindset
- •Experience in organising and delivering scientific workshops
Master-Abschluss
Berufserfahrung
ca. 1 – 4 Jahre
Deine Aufgaben
- •Develop software to enhance the SpatialData framework's robustness and scalability
- •Maintain the SpatialData framework, focusing on refactoring code for stability and easier maintenance
- •Contribute to the Next Generation File Format (NGFF) and OME-Zarr specifications for bioimaging data
- •Set up, test, and ensure the smooth operation of continuous integration and automation systems
- •Improve documentation, example notebooks, and training materials for the SpatialData framework
Tools & Technologien
Pythondaskxarraygeopandaszarrome-zarrnapariAnnDataScanpySpatialData
Sprachen
Englisch – verhandlungssicher
Deine Vorteile
Sonstige Zulagen
- •Salary free of income tax
- •Child allowances
- •Non-resident allowances
- •Education grant for private schooling
- •Financial support for travel home
- •Monthly non-resident allowance
Familienfreundlichkeit
- •Monthly family allowances
- •10 days child sick leave
Attraktive Vergütung
- •Annual salary review
Betriebliche Altersvorsorge
- •Pension scheme
Sonstige Vorteile
- •Death benefit
- •Long-term care insurance
- •Relocation package
- •On-site library
Sicherer Arbeitsplatz
- •Accident-at-work insurance
Flexibles Arbeiten
- •Flexible working arrangements
Gesundheits- & Fitnessangebote
- •Private medical insurance
- •Subsidised gym
Mehr Urlaubstage
- •30 days annual leave
Parkplatz & Pendelvorteile
- •Free shuttle bus
Lockere Unternehmenskultur
- •Casual dress code
Team Events & Ausflüge
- •Sports and social club activities
Kinderbetreuung
- •Kindergarten
Großzügige Elternzeit
- •Generous paid maternity leave
Die Originalanzeige dieses Stellenangebotes in der aktuellsten Version findest du hier. Nejo hat diesen Job automatisch von der Website des Unternehmens European Molecular Biology Laboratory erfasst und die Informationen auf Nejo mit Hilfe von KI für dich aufbereitet. Trotz sorgfältiger Analyse können einzelne Informationen unvollständig oder ungenau sein. Bitte prüfe immer alle Angaben in der Originalanzeige! Inhalte und Urheberrechte der Originalanzeige liegen beim ausschreibenden Unternehmen.
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