Universitätsklinikum Erlangen
Wissenschaftlicher Mitarbeiter(m/w/x)
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Erlangen
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UNUniklinikum Erlangen
Medical Data Scientist / Medizin- oder Bioinformatiker(m/w/x)
Erlangen
Full-time, Part-timeTemporary contractOn-siteExperienced
AI/ML
Data Science
Nejo AI Summary
Analyse und Visualisierung von Single-Cell-, Bulk-RNA-seq- und Omics-Datensätzen in einem Uniklinikum. Studium in Bioinformatik, Computational Biology oder Data Science erforderlich. Tarifvertrag und VBL-Zusatzvorsorge.
Requirements
- Fachliches Know-how
- Studium Bioinformatik, Computational Biology, Data Science oder vergleichbar
- Kenntnisse der FAIR-Prinzipien und deren Umsetzung
- Erfahrung mit biomedizinischen Daten und Metadatenstandards
- Praxis in Datenversionierung und Workflow-Management
- Erfahrung in der Analyse von Hochdurchsatzdaten
- Sicherer Umgang mit Python, R und Bioinformatik-Frameworks
- Kenntnisse in Statistik, Machine Learning und GNNs
- Teamfähigkeit, selbstständige Arbeitsweise und interdisziplinäre Zusammenarbeit
Tasks
- Forschungsdatenmanagement gemäß FAIR-Prinzipien umsetzen
- Langfristige Datenverfügbarkeit und -nachnutzbarkeit sicherstellen
- Single-Cell-, Bulk-RNA-seq- und Omics-Datensätze analysieren
- Statistische Methoden für großskalige biologische Daten entwickeln
- Komplexe molekularbiologische Ergebnisse visualisieren und interpretieren
- Eng mit experimentellen Partner:innen zusammenarbeiten
- Wissenschaftliche Publikationen erstellen und veröffentlichen
- Ergebnisse auf Fachveranstaltungen präsentieren
Work Experience
- approx. 1 - 4 years
Education
- Master's degree
Languages
- German – Business Fluent
Tools & Technologies
- MIAME
- MINSEQE
- OME
- Git
- Snakemake
- Nextflow
- Python
- R
- Scanpy
- Seurat
- Bioconductor
- Graph Neural Networks
Benefits
Job Security
- Krisensicherer Arbeitsplatz
Retirement Plans
- Zusatzvorsorge der VBL
Diverse Work
- Interessante Tätigkeit
Informal Culture
- Motiviertes, aufgeschlossenes Team
Mentorship & Coaching
- Sorgfältige und qualifizierte Einarbeitung
Healthcare & Fitness
- Angebot zur Gesundheitsförderung
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Not a perfect match?
- Universitätsklinikum Erlangen
(Medizin-)Informatiker(m/w/x)
Full-time/Part-timeTemporary contractOn-siteExperiencedErlangen - Universitätsklinikum Erlangen
(Medizin-)Informatiker(m/w/x)
Full-time/Part-timeTemporary contractOn-siteExperiencedErlangen - Universitätsklinikum Erlangen
PhD Position – AI-based Multi-Omics in Computational Biomedicine(m/w/x)
Full-timeOn-siteNot specifiedErlangen - Universitätsklinikum Erlangen
Postdoctoral Researcher – AI-based Multi-Omics in Computational Biomedicine(m/w/x)
Full-timeOn-siteJuniorErlangen
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Requirements
- Fachliches Know-how
- Studium Bioinformatik, Computational Biology, Data Science oder vergleichbar
- Kenntnisse der FAIR-Prinzipien und deren Umsetzung
- Erfahrung mit biomedizinischen Daten und Metadatenstandards
- Praxis in Datenversionierung und Workflow-Management
- Erfahrung in der Analyse von Hochdurchsatzdaten
- Sicherer Umgang mit Python, R und Bioinformatik-Frameworks
- Kenntnisse in Statistik, Machine Learning und GNNs
- Teamfähigkeit, selbstständige Arbeitsweise und interdisziplinäre Zusammenarbeit
Tasks
- Forschungsdatenmanagement gemäß FAIR-Prinzipien umsetzen
- Langfristige Datenverfügbarkeit und -nachnutzbarkeit sicherstellen
- Single-Cell-, Bulk-RNA-seq- und Omics-Datensätze analysieren
- Statistische Methoden für großskalige biologische Daten entwickeln
- Komplexe molekularbiologische Ergebnisse visualisieren und interpretieren
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- Bioconductor
- Graph Neural Networks
Benefits
Job Security
- Krisensicherer Arbeitsplatz
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- Zusatzvorsorge der VBL
Diverse Work
- Interessante Tätigkeit
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- Sorgfältige und qualifizierte Einarbeitung
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About the Company
Uniklinikum Erlangen
Industry
Healthcare
Description
Das Medizinische Zentrum für Informations- und Kommunikationstechnik (MIK) betreut die IT-Anforderungen und den Betrieb der zentralen IT-Infrastruktur des Uniklinikums.
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PhD Position – AI-based Multi-Omics in Computational Biomedicine(m/w/x)
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Postdoctoral Researcher – AI-based Multi-Omics in Computational Biomedicine(m/w/x)
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