German Cancer Research Center (DKFZ)
Data Scientist – Multi-Omics and Machine Learning for Prostate Cancer Early Detection(m/w/x)
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Heidelberg
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GEGerman Cancer Research Center
Postdoctoral Researcher — Biomedical Semantics, Ontologies, and Large Language Model Integration(m/w/x)
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Nejo KI-Zusammenfassung
Designing domain ontologies and knowledge graphs for structured biomedical data integration. Experience with semantic web technologies and graph databases required. 30 days vacation, international exchange opportunities.
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Anforderungen
- Master's degree in life sciences, computer science, mathematics, physics, or engineering
- Strong computational and data analysis skills
- Good knowledge of Python, R, or similar programming
- Experience with semantic web technologies (SPARQL, RDF triple stores)
- Experience with graph databases and knowledge graphs for biomedical data integration
- Solid understanding of biomedical data contexts (preclinical/clinical trials, imaging, omics)
- Familiarity with data standards (CDISC, FHIR, OMOP CDM, OBO ontologies) highly desirable
- Team player
- Good English proficiency
Aufgaben
- Design and implement domain ontologies
- Develop and maintain knowledge graphs
- Create semantic data models
- Enable structured integration of biomedical data
- Work with LLM-based systems
- Collaborate with data scientists, clinicians, and AI researchers
- Ensure semantic interoperability
- Adhere to FAIR data principles
- Maintain robust metadata standards
- Develop semantic pipelines and APIs
- Integrate structured knowledge with LLM workflows
- Contribute to research publications
- Participate in open-source tools development
- Stay updated with methodology through training
Ausbildung
Doktor / Ph.D.
Sprachen
Englisch – verhandlungssicher
Tools & Technologien
PythonRSPARQLRDF triple storesGraph databasesKnowledge graphsCDISCFHIROMOP Common Data ModelOBO ontologies
Benefits
Betriebliche Altersvorsorge
- Company pension plan
Sonstige Vorteile
- Capital-forming benefits
- DKFZ International Postdoc Program access
Modernes Büro
- State-of-the-art infrastructure
Workation & Sabbatical
- International exchange opportunities
Mehr Urlaubstage
- 30 days of vacation
Flexibles Arbeiten
- Flexible working hours
- Mobile work option
- Part-time work option
Familienfreundlichkeit
- Family-friendly work environment
Öffi Tickets
- Discounted Germany Job Ticket
Gesundheits- & Fitnessangebote
- Company health management
Karriere- und Weiterentwicklung
- DKFZ Career Service access
Weiterbildungsangebote
- Personal development programs
Von Nejo automatisch aufbereitet
Nejo hat diesen Job automatisch von der Website des Unternehmens German Cancer Research Center erfasst und die Informationen auf Nejo mit Hilfe von KI für dich aufbereitet. Trotz sorgfältiger Analyse können einzelne Informationen unvollständig oder ungenau sein. Bitte prüfe immer alle Angaben in der Originalanzeige! Inhalte und Urheberrechte der Originalanzeige liegen beim ausschreibenden Unternehmen.
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GE
ResearchHeidelberg
The German Cancer Research Center (DKFZ) is one of Europe’s largest cancer research centers focused on innovative cancer research.
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Nejo bewertet ihn, und bringt ihn danach gemeinsam mit dir in Bestform.
Du hast noch keinen Lebenslauf?
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- ExxetaSenior Ontology & Knowledge Graph Engineer(m/w/x)Vollzeitmit HomeofficeSeniorBerlin, Karlsruhe, Mannheim
- German Cancer Research Center (DKFZ)DKFZ Postdoctoral Fellowships(m/w/x)Vollzeitmit HomeofficeBerufserfahrenDresden, Heidelberg
- SAPPhD Internship - AI Research - Knowledge Graphs for Agentic AI(m/w/x)VollzeitPraktikumRemoteBerlin, Walldorf
- vitagroup AGTechnical Consultant – Data Engineering(m/w/x)Vollzeitmit HomeofficeBerufserfahrenMannheim