Fraunhofer Institute for Digital Medicine MEVIS
Master's thesis Data-Linkage-Systems for Integrated Health, Geospatial and Population Data(m/w/x)
VollzeitPraktikumnur vor Ort
Hamburg
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BEBernhard Nocht Institute for Tropical Medicine
PhD Student in data science(m/w/x)
Hamburg
VollzeitVor Ort
AI/ML
Data Science
Nejo KI-Zusammenfassung
Developing transformer- and graph-based models for single-cell RNA-seq and spatial transcriptomics at tropical medicine research institute. Advanced Python or R programming expertise in Linux environments required. 30 days vacation, state-of-the-art laboratory facilities.
Anforderungen
- Master’s degree in Computer Science, Bioinformatics, or related fields
- Master’s degree in Biological sciences with strong programming background
- Expertise in programming, Python or R
- Expertise in Linux environments
- Interest in biological questions and disease mechanisms
- Understanding of LLMs and transformer models
- Experience with genomics, transcriptomics, or NGS (plus)
- Expertise in AI/ML (plus)
- Experience with job submission systems/HPC (plus)
- Proficiency in English (oral and written)
- Excellent organisational and independent planning skills
- Strong team spirit and communication skills
- Creative mindset and problem-solving capabilities
- Proficiency in office software (Office, Adobe)
Aufgaben
- Leverage large-scale single-cell RNA-seq datasets
- Utilize spatial transcriptomics datasets
- Develop transformer- and graph-based models
- Capture cellular responses across tissues
- Investigate systematic biases and biological confounders
- Develop computational strategies to correct biases
- Build predictive models for in silico perturbations
- Simulate genetic and pharmacological interventions
- Advance foundation models for host-pathogen systems
- Train, explore, and modify transformer models
- Characterize the impact of confounding variables
- Integrate multimodal host-pathogen data sources
- Establish pipelines for drug target discovery
- Apply models to immunological datasets
- Provide bioinformatics support to research groups
- Support teaching and training activities
- Contribute to independent research initiatives
Ausbildung
- Master-Abschluss
Sprachen
- Englisch – verhandlungssicher
Tools & Technologien
- Python
- R
- Linux
- LLMs
- transformer models
- next-generation sequencing analysis
- AI/ML
- HPC
- Office
- Adobe
Benefits
Lockere Unternehmenskultur
- Creative, supportive, motivated team
Startup-Atmosphäre
- Interdisciplinary research environment
Modernes Büro
- State-of-the-art facilities
Sinnstiftende Arbeit
- Independent research project opportunities
Mehr Urlaubstage
- 30 days of vacation
Flexibles Arbeiten
- Flexible and family-friendly hours
Sonstige Zulagen
- Childcare subsidy
Öffi Tickets
- Deutschlandticket subsidy
Betriebliche Altersvorsorge
- Company pension scheme
Weiterbildungsangebote
- Further education and training
Die Originalanzeige dieses Stellenangebotes in der aktuellsten Version findest du hier. Nejo hat diesen Job automatisch von der Website des Unternehmens Bernhard Nocht Institute for Tropical Medicine erfasst und die Informationen auf Nejo mit Hilfe von KI für dich aufbereitet. Trotz sorgfältiger Analyse können einzelne Informationen unvollständig oder ungenau sein. Bitte prüfe immer alle Angaben in der Originalanzeige! Inhalte und Urheberrechte der Originalanzeige liegen beim ausschreibenden Unternehmen.
Noch nicht perfekt?
- Bernhard-Nocht-Institut fuer Tropenmedizin Jobportal
Postdoc - clinical implementation research(m/w/x)
Vollzeitnur vor OrtBerufserfahrenHamburg - Evotec SE
Head of Quantitative Biomarker Sciences(m/w/x)
Vollzeitnur vor OrtSeniorHamburg - Fraunhofer-Gesellschaft
Masterarbeit im Bereich Data-Linkage-Systems für integrierte Gesundheits-, Geo- & Bevölkerungsdaten(m/w/x)
VollzeitPraktikumnur vor OrtHamburg - Bernhard-Nocht-Institut für Tropenmedizin
Technische Assistentin/Technischer Assistent (MTA, BTA etc.) oder Biologielaborant:in(m/w/x)
VollzeitBefristeter Vertragnur vor OrtKeine AngabeHamburg
BEBernhard Nocht Institute for Tropical Medicine
PhD Student in data science(m/w/x)
Hamburg
VollzeitVor Ort
AI/ML
Data Science
Nejo KI-Zusammenfassung
Developing transformer- and graph-based models for single-cell RNA-seq and spatial transcriptomics at tropical medicine research institute. Advanced Python or R programming expertise in Linux environments required. 30 days vacation, state-of-the-art laboratory facilities.
Anforderungen
- Master’s degree in Computer Science, Bioinformatics, or related fields
- Master’s degree in Biological sciences with strong programming background
- Expertise in programming, Python or R
- Expertise in Linux environments
- Interest in biological questions and disease mechanisms
- Understanding of LLMs and transformer models
- Experience with genomics, transcriptomics, or NGS (plus)
- Expertise in AI/ML (plus)
- Experience with job submission systems/HPC (plus)
- Proficiency in English (oral and written)
- Excellent organisational and independent planning skills
- Strong team spirit and communication skills
- Creative mindset and problem-solving capabilities
- Proficiency in office software (Office, Adobe)
Aufgaben
- Leverage large-scale single-cell RNA-seq datasets
- Utilize spatial transcriptomics datasets
- Develop transformer- and graph-based models
- Capture cellular responses across tissues
- Investigate systematic biases and biological confounders
- Develop computational strategies to correct biases
- Build predictive models for in silico perturbations
- Simulate genetic and pharmacological interventions
- Advance foundation models for host-pathogen systems
- Train, explore, and modify transformer models
- Characterize the impact of confounding variables
- Integrate multimodal host-pathogen data sources
- Establish pipelines for drug target discovery
- Apply models to immunological datasets
- Provide bioinformatics support to research groups
- Support teaching and training activities
- Contribute to independent research initiatives
Ausbildung
- Master-Abschluss
Sprachen
- Englisch – verhandlungssicher
Tools & Technologien
- Python
- R
- Linux
- LLMs
- transformer models
- next-generation sequencing analysis
- AI/ML
- HPC
- Office
- Adobe
Benefits
Lockere Unternehmenskultur
- Creative, supportive, motivated team
Startup-Atmosphäre
- Interdisciplinary research environment
Modernes Büro
- State-of-the-art facilities
Sinnstiftende Arbeit
- Independent research project opportunities
Mehr Urlaubstage
- 30 days of vacation
Flexibles Arbeiten
- Flexible and family-friendly hours
Sonstige Zulagen
- Childcare subsidy
Öffi Tickets
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Betriebliche Altersvorsorge
- Company pension scheme
Weiterbildungsangebote
- Further education and training
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Über das Unternehmen
Bernhard Nocht Institute for Tropical Medicine
Branche
Research
Beschreibung
The Bernhard Nocht Institute for Tropical Medicine (BNITM) is the largest Research Institute for Tropical Medicine in Germany.
Noch nicht perfekt?
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Master's thesis Data-Linkage-Systems for Integrated Health, Geospatial and Population Data(m/w/x)
VollzeitPraktikumnur vor OrtHamburg - Bernhard-Nocht-Institut fuer Tropenmedizin Jobportal
Postdoc - clinical implementation research(m/w/x)
Vollzeitnur vor OrtBerufserfahrenHamburg - Evotec SE
Head of Quantitative Biomarker Sciences(m/w/x)
Vollzeitnur vor OrtSeniorHamburg - Fraunhofer-Gesellschaft
Masterarbeit im Bereich Data-Linkage-Systems für integrierte Gesundheits-, Geo- & Bevölkerungsdaten(m/w/x)
VollzeitPraktikumnur vor OrtHamburg - Bernhard-Nocht-Institut für Tropenmedizin
Technische Assistentin/Technischer Assistent (MTA, BTA etc.) oder Biologielaborant:in(m/w/x)
VollzeitBefristeter Vertragnur vor OrtKeine AngabeHamburg