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EUEuropean Molecular Biology Laboratory

Research Software Engineer - Spatial-omics(m/w/x)

Heidelberg
ab 4.031,02 / Monat
Vollzeitmit HomeofficeBerufserfahren

At biology data management tech developer, enhancing SpatialData framework for bioimaging data specifications. Knowledge of dask, xarray, zarr, or other scverse Python libraries required. Income tax-free salary, monthly family and child allowances.

Anforderungen

  • Master’s degree in Computer Science, Mathematics, Physics, Engineering, Life Sciences, or related field, or proven equivalent experience
  • Knowledge of Python libraries: dask, xarray, geopandas, zarr, ome-zarr, napari, AnnData, Scanpy, SpatialData, or other scverse software
  • Curiosity-driven mindset toward new methods and tech
  • Passion for open-source software and commitment to reducing adoption barriers
  • Excellent communication and organisational skills
  • Proven ability to work creatively and rigorously in a team environment
  • Fluency in English
  • Experience contributing to open-source projects, using git and familiar with GitHub workflows
  • Background in user support (software support, scientific support)
  • Bioinformatics experience in single-cell and spatial biology with a learning mindset
  • Experience in organising and delivering scientific workshops

Aufgaben

  • Develop software to enhance the SpatialData framework's robustness and scalability
  • Maintain the SpatialData framework, focusing on refactoring code for stability and easier maintenance
  • Contribute to the Next Generation File Format (NGFF) and OME-Zarr specifications for bioimaging data
  • Set up, test, and ensure the smooth operation of continuous integration and automation systems
  • Improve documentation, example notebooks, and training materials for the SpatialData framework

Berufserfahrung

  • ca. 1 - 4 Jahre

Ausbildung

  • Master-Abschluss

Sprachen

  • Englischverhandlungssicher

Tools & Technologien

  • Python
  • dask
  • xarray
  • geopandas
  • zarr
  • ome-zarr
  • napari
  • AnnData
  • Scanpy
  • SpatialData

Benefits

Sonstige Zulagen

  • Salary free of income tax
  • Child allowances
  • Non-resident allowances
  • Education grant for private schooling
  • Financial support for travel home
  • Monthly non-resident allowance

Familienfreundlichkeit

  • Monthly family allowances
  • 10 days child sick leave

Attraktive Vergütung

  • Annual salary review

Betriebliche Altersvorsorge

  • Pension scheme

Sonstige Vorteile

  • Death benefit
  • Long-term care insurance
  • Relocation package
  • On-site library

Sicherer Arbeitsplatz

  • Accident-at-work insurance

Flexibles Arbeiten

  • Flexible working arrangements

Gesundheits- & Fitnessangebote

  • Private medical insurance
  • Subsidised gym

Mehr Urlaubstage

  • 30 days annual leave

Parkplatz & Pendelvorteile

  • Free shuttle bus

Lockere Unternehmenskultur

  • Casual dress code

Team Events & Ausflüge

  • Sports and social club activities

Kinderbetreuung

  • Kindergarten

Großzügige Elternzeit

  • Generous paid maternity leave
Die Originalanzeige dieses Stellenangebotes in der aktuellsten Version findest du hier. Nejo hat diesen Job automatisch von der Website des Unternehmens European Molecular Biology Laboratory erfasst und die Informationen auf Nejo mit Hilfe von KI für dich aufbereitet. Trotz sorgfältiger Analyse können einzelne Informationen unvollständig oder ungenau sein. Bitte prüfe immer alle Angaben in der Originalanzeige! Inhalte und Urheberrechte der Originalanzeige liegen beim ausschreibenden Unternehmen.

  • European Molecular Biology Laboratory

    Laboratory Officer (Bioinformatics / Computational Biology)(m/w/x)

    Vollzeitmit HomeofficeSenior
    Heidelberg
  • EMBL

    Postdoc / Research Scientist Computational Precision Oncology(m/w/x)

    Vollzeitmit HomeofficeBerufserfahren
    Heidelberg
  • German Cancer Research Center (DKFZ)

    Scientific Solution Architect(m/w/x)

    Vollzeitmit HomeofficeSenior
    Heidelberg
  • EMBL Heidelberg

    Data Management & Web Support - GeneCore(m/w/x)

    Vollzeitmit HomeofficeBerufseinsteiger
    Heidelberg
  • Snke

    Project Engineer for Healthcare Data Modelling(m/w/x)

    Vollzeitmit HomeofficeBerufserfahren
    München, Heidelberg
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